Metabolomika 320-BTS2-2MET
Kierunek studiów: Biotechnologia
Profil studiów: ogólnoakademicki
Dziedzina: nauki ścisłe i przyrodnicze, dyscyplina nauki biologiczne
Forma studiów: stacjonarne
Rodzaj przedmiotu: przedmiot obowiązkowy, moduł kierunkowy
Dziedzina nauki ścisłe i przyrodnicze, dyscyplina nauki biologiczne
Rok studiów /semestr: II rok drugiego stopnia, semestr III / semestr zimowy
Wymagania wstępne: student powinien posiadać zakres wiadomości z biochemii, podstaw biotechnologii, chemii organicznej
Liczba godzin zajęć dydaktycznych z podziałem na formy prowadzenia zajęć: wykład – 10 godz., laboratorium – 20 godz.
Metody dydaktyczne: wykład, metoda laboratoryjna, pomiar, konsultacje
Punkty ECTS: 2
Bilans nakładu pracy studenta: ogólny nakład pracy studenta: 50 godz. w tym: udział w wykładach: 10 godz.; udział w zajęciach laboratoryjnych: 20 godz.; przygotowanie się do zajęć, zaliczeń, egzaminów: 18 godz.; udział w konsultacjach, zaliczeniach, egzaminie: 2 godz.
Wskaźniki ilościowe:
nakład pracy studenta związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczyciela 32 godz.,
nakład pracy studenta związany z zajęciami o charakterze praktycznym: 20 godz.
Celem wykładów jest zapoznanie studentów z metabolomiką oraz praktycznymi możliwościach jej wykorzystania w medycynie, monitoringu leczenia, monitoringu rozwoju choroby, diagnostyce medycznej. Historia metabolomiki. Podstawowe definicje związane z biologią systemów, sposoby (analizy celowane i niecelowane) i techniki wykorzystywane do oznaczania metabolitów z naciskiem na chromatografię cieczową połączoną ze spektrometrią mas (LC-MS). Podstawy techniki LC-MS, rodzaje analizatorów mas. Projektowanie badań metabolomicznych: dobór grup badanych, zbieranie i przechowywanie materiału biologicznego, planowanie eksperymentu. Analiza i kontrola jakości uzyskanych danych, sposoby identyfikacji metabolitów. Analiza szlaków metabolicznych, prezentacja wyników przeprowadzonych badań.
Rodzaj przedmiotu
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Wiedza:
1. Student zna w pogłębionym stopniu istotne zagadnienia dotyczące molekularnych, biochemicznych i fizjologicznych aspektów funkcjonowania komórek, tkanek i organizmów KP7_WG2.
2. Student zna w pogłębionym stopniu zagadnienia dotyczące struktury i funkcji produktów naturalnych i możliwości ich biotechnologicznego wykorzystania KP7_WG3.
Umiejętności:
1. Student potrafi dobrać, adekwatnie do założonych celów oraz stosować metody i narzędzia badawcze, w tym zaawansowane techniki pomiarowe i laboratoryjne, odpowiednio je przystosować lub opracować nowe KP7_UW2.
Kompetencje społeczne:
1. Student jest gotów do konsekwentnego stosowania w pracy badawczej i działaniach praktycznych zasady interpretowania zjawisk i procesów biologicznych na podstawie danych empirycznych KP7_KK2.
Kryteria oceniania
Dopuszczenie do egzaminu: pozytywna ocena zaliczenia laboratorium. Zaliczenie wykładu: pozytywna ocena z egzaminu pisemnego (test zamknięty lub pytania otwarte).
Ilościowe kryteria oceny osiągnięć weryfikowanych za pomocą pisemnych egzaminów i prac zaliczeniowych na Wydziale Biologii (zgodne z paragrafem 23 ust. 6 Regulaminu studiów UwB z dnia 26 czerwca 2019 r.)
Literatura
1. A. Kraj, A. Drabik, J. Silberring, Proteomika i metabolomika. WUW Warszawa 2019
2. M. Stobiecki. Metabolomika – narzędzie w genomice funkcjonalnej i biologii systemów. Biotechnologia 2009, 2 (85):2.
54-64.
3. J. Nielsen, M.C. Jewett, Metabolomics: A Powerful Tool in Systems Biology. Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2007.
4. Chemometria praktyczna, J. Mazerski, Wydawnictwo Malamut, wyd. II, 2016.
5. Spektrometria Mas (Wydawnictwo AGH) Edytorzy: Piotr Suder, Anna Bodzoń-
Kułakowska, Jerzy Silberring. Kraków 2016; ISBN: 978-83-7464-848-6.
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: